Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal2aA2A9G7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal2aA2A9G7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2aA2A9G7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms