Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RlfA2A7F4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RlfA2A7F4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RlfA2A7F4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RlfA2A7F4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RlfA2A7F4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.1 ms