Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Prdm2A2A7B5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Prdm2A2A7B5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Prdm2A2A7B5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prdm2A2A7B5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm2A2A7B5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm2A2A7B5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm2A2A7B5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms