Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calcoco2A2A6M5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calcoco2A2A6M5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calcoco2A2A6M5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Calcoco2A2A6M5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 840.4 ms