Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pgap3A2A559 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pgap3A2A559 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pgap3A2A559 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pgap3A2A559 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pgap3A2A559 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms