Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc112A0AUP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc112A0AUP1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc112A0AUP1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc112A0AUP1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms