Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms