Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top3bQ9Z321 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top3bQ9Z321 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top3bQ9Z321 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Top3bQ9Z321 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Top3bQ9Z321 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3bQ9Z321 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms