Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms