Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbck1Q9WUB0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbck1Q9WUB0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms