Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nrf1Q9WU00 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms