Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdh13Q9WTR5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms