Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bcl11aQ9QYE3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bcl11aQ9QYE3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms