Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms