Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1eQ9JMK2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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