Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms