Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmod3Q9JHJ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms