Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms