Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slco1c1Q9ERB5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms