Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rapgef4Q9EQZ6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rapgef4Q9EQZ6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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