Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tpcn1Q9EQJ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tpcn1Q9EQJ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tpcn1Q9EQJ0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tpcn1Q9EQJ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpcn1Q9EQJ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tpcn1Q9EQJ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tpcn1Q9EQJ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tpcn1Q9EQJ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tpcn1Q9EQJ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpcn1Q9EQJ0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Tpcn1Q9EQJ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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