Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xab2Q9DCD2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms