Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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