Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms