Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms