Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms