Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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