Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan11Q9D1D1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms