Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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