Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thumpd2Q9CZB3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms