Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnih4Q9CX13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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