Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot11Q9CWN7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms