Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB0

Snx24, Sorting nexin-24, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx24Q9CRB0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx24Q9CRB0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms