Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PompQ9CQT5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms