Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed6Q9CQG0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed6Q9CQG0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms