Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms