Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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