Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Krt88Q9CPR6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt88Q9CPR6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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