Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ROPN1BQ9BZX4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms