Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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