Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms