Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc115Q8VE99 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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