Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms