Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lrrtm1Q8K377 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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