Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brd3Q8K2F0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brd3Q8K2F0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms