Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d5Q8JZW5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms