Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog3Q8CI04 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms