Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fam228aQ8CDW1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fam228aQ8CDW1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fam228aQ8CDW1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fam228aQ8CDW1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam228aQ8CDW1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fam228aQ8CDW1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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