Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo43Q8CDI2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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