Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms